ПОДКРЕПЛЕННЫЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ-К-ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ КОНКУРЕНТНЫЙ АВТОЭНКОДЕР ДЛЯ ГЕНЕРАЦИИ МАЛЫХ ОРГАНИЧЕСКИХ МОЛЕКУЛЯРНЫХ СТРУКТУР
Аннотация:
Предмет исследования. Исследованы современные модели глубокого обучения для генерации целевых малых органических молекулярных структур. Исследования проводились на двух выборках размером в 250 000 лекарственно-подобных молекулярных соединений из базы ZINCи 23 000 активных ингибиторов киназ, собранных вручную из открытой базы ChemBL. Метод. Предложена модель глубокой нейронной сети, основанная на концепциях конкурентного обучения и обучения с учителем. Модель контролирует молекулярную восстанавливаемость генерируемых структур за счет использования конкурентный seq2seqавтоэнкодера и внешнего генератора. Наличие внешнего генератора обеспечивает гибкость модели в выборе архитектуры, а также позволяет подавать на вход условия для генерации. Основные результаты. Сравнительные эксперименты показали, что предложенная модель превзошла ближайших конкурентов в экспериментах с предобучением и дообучением с точки зрения генерации валидных и уникальных молекулярных структур. Дополнительный химический анализ генерируемых структур демонстрирует лучшее качество генерации предлагаемой модели в сравнении с другими моделями конкурентами. Практическая значимость. Предложенная модель может быть использована для разработки новых лекарственных препаратов медицинскими химиками в качестве умного помощника.
Ключевые слова:
Постоянный URL
Статьи в номере
- СОВРЕМЕННЫЕ УСТОЙЧИВЫЕ МАТЕМАТИЧЕСКИЕ И ПРОГРАММНЫЕ МЕТОДЫ ВОССТАНОВЛЕНИЯ ИСКАЖЕННЫХ СПЕКТРОВ
- КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ДЕТЕКТОРА ГАММА-ИЗЛУЧЕНИЯ НА ОСНОВЕ СЦИНТИЛЛЯЦИОННОГО КРИСТАЛЛА И КРЕМНИЕВОГО ФОТОУМНОЖИТЕЛЯ
- ИССЛЕДОВАНИЕ АКУСТИЧЕСКОГО СИГНАЛА ПРИ ЛАЗЕРНОЙ ГИДРОАКУСТИЧЕСКОЙ ОБРАБОТКЕ БИОТКАНИ МИКРОСЕКУНДНЫМИ ИМПУЛЬСАМИ ИЗЛУЧЕНИЯ ЛАЗЕРА НА ИТТЕРБИЙ-ЭРБИЕВОМ СТЕКЛЕ
- ПОДБОР ПАРАМЕТРОВ ОПТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ И ПОДХОДЫ К РАЗРАБОТКЕ ПРОГРАММНОГО ОБЕСПЕЧЕНИЯ КОМПЛЕКСА ТЕХНИЧЕСКОГО ЗРЕНИЯ ДЛЯ ТРЕХМЕРНОЙ ПЕЧАТИ
- ВЕКТОРНО-МАТРИЧНЫЙ МЕТОД ВОССТАНОВЛЕНИЯ ПРОСТРАНСТВЕННЫХ КООРДИНАТ ТОЧКИ В ОБЩЕМ СЛУЧАЕ СТЕРЕОСЪЕМКИ
- РАСЧЕТ ТЕРМОНЕРАССТРАИВАЕМЫХ ИНФРАКРАСНЫХ ОБЪЕКТИВОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ДИФРАКЦИОННЫХ ПОВЕРХНОСТЕЙ
- ЧАСТОТНАЯ И ФАЗОВАЯ СИНХРОНИЗАЦИЯ СИГНАЛОВ С МАССИВА ОПТОВОЛОКОННЫХ ГИДРОАКУСТИЧЕСКИХ ДАТЧИКОВ
- ИДЕНТИФИКАЦИЯ ПАРАМЕТРОВ СИНУСОИДАЛЬНОГО СИГНАЛА С НЕИЗВЕСТНОЙ НЕСТАЦИОНАРНОЙ АМПЛИТУДОЙ
- ДИЭЛЕКТРИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ПОЛИУРЕТАНОВЫХ НАНОКОМПОЗИТОВ, МОДИФИЦИРОВАННЫХ ФУЛЛЕРЕНОМ С60 И НАНОАЛМАЗАМИ
- ПРИМЕНЕНИЕ ВЕЩЕСТВ С ФАЗОВЫМИ ПЕРЕХОДАМИ ДЛЯ АККУМУЛИРОВАНИЯ ТЕПЛОВОЙ ЭНЕРГИИ
- МЕТОД НАНЕСЕНИЯ ОГНЕЗАЩИТНОГО КОМПОЗИТНОГО МАТЕРИАЛА «ЖИДКОЕ СТЕКЛО–МИКРОЧАСТИЦЫ ГРАФИТА» НА ПОВЕРХНОСТИ ОГРАЖДЕНИЯ
- СОЗДАНИЕ НАДЕЖНЫХ КОДОВ НА ОСНОВЕ БЕНТ-ФУНКЦИЙ И ВЕЙВЛЕТ-ПРЕОБРАЗОВАНИЙ
- АЛГОРИТМ ГРАДИЕНТНОГО БУСТИНГА ДЕРЕВЬЕВ РЕШЕНИЙ В ЗАДАЧЕ ИДЕНТИФИКАЦИИ ПРОГРАММНОГО ОБЕСПЕЧЕНИЯ
ОТКРЫТЫЕ DATAFLOW-СИСТЕМЫ С СЕТЕВОЙ СТРУКТУРОЙ
СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ МОДЕЛЬ ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ ИНФОКОММУНИКАЦИОННОЙ СИСТЕМЫ
- ИМИТАЦИОННАЯ МОДЕЛЬ ЛОКАЛЬНОЙ КОМПЬЮТЕРНОЙ СЕТИ С АГРЕГИРОВАНИЕМ КАНАЛОВ И СЛУЧАЙНЫМ МЕТОДОМ ДОСТУПА ПРИ РЕЗЕРВИРОВАНИИ ПЕРЕДАЧ
- АНАЛИЗ ЭНТРОПИИ ПОКАЗАНИЙ ИНЕРЦИАЛЬНОГО МОДУЛЯ КИБЕРФИЗИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ ПРИ ОТСУТСТВИИ ВНЕШНИХ ВОЗМУЩЕНИЙ
- ПРИМЕНЕНИЕ СХЕМЫ С НАСТРАИВАЕМЫМИ ДИССИПАТИВНЫМИ СВОЙСТВАМИ В ЗАДАЧЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ УДАРНОЙ ВОЛНЫ С ГЕЛИЕВЫМ ПУЗЫРЕМ
- ПОДХОДЫ К АНАЛИЗУ ВЗАИМОСВЯЗИ ГЕНОТИПА И ФЕНОТИПА ПРИ ПОМОЩИ QTL-АНАЛИЗА
- МЕТОД СИНТЕЗА АЛФАВИТОВ ОРТОГОНАЛЬНЫХ СИГНАЛЬНЫХ ШИРОКОПОЛОСНЫХ СООБЩЕНИЙ
АНАЛИЗ ШУМОВЫХ СОСТАВЛЯЮЩИХ КВАРЦЕВОГО МАЯТНИКОВОГО АКСЕЛЕРОМЕТРА С ЦИФРОВЫМ УСИЛИТЕЛЕМ ОБРАТНОЙ СВЯЗИ
- ИССЛЕДОВАНИЕ АЛГОРИТМОВ ПОИСКА ТОЧКИ МАКСИМАЛЬНОЙ МОЩНОСТИ ДЛЯ ПОВЫШЕНИЯ ЭФФЕКТИВНОСТИ ФОТОЭЛЕКТРИЧЕСКИХ ПРЕОБРАЗОВАТЕЛЕЙ
ПОДДЕРЖАНИЕ ИНТЕРНАЛЬНОЙ НЕПРОТИВОРЕЧИВОСТИ АЛГЕБРАИЧЕСКИХ БАЙЕСОВСКИХ СЕТЕЙ С ЛИНЕЙНОЙ И ЗВЕЗДЧАТОЙ СТРУКТУРОЙ